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妙木山，鸣人在这里修炼着仙术。
自从忍者联军总部被宇智波斑攻破后。水门就将鸣人交给了自来也，让他去前往妙木山学习仙术。
水门很清楚，忍者联军拖延不了宇智波斑多久时间。所以他把鸣人送走了，同时也安排着新一代的一些年轻人送往了妙木山，用来保留未来的火种。即使宇智波斑真的胜利路创造了无限月读的世界，只要这些孩子还在，那么这个世界就就还会有希望。
看着被自来也带回来的鸣人，大蛤蟆仙人似乎看到了未来。自从数十年前世界的变化他已经很久没有做出过什么语言了。现在随着自来也将真正的命运之子带到妙木山，他看到了未来的希望。立刻就同意了让波风鸣人学习仙术。
和鸣人一样在，小樱被纲手收为弟子教导其医疗忍术。在纲手的指引下小樱和湿骨林签订了通灵契约。
佐助叛逃了，哥哥的死对佐助刺激很大，同时看着鸣人和小樱都拥有了前进的方向他充满了迷茫，在大蛇丸的蛊惑下他离开了忍者联军前往了龙地洞修行。
世界似乎随着火羽的离开，又恢复到了原点。此时与世隔绝的龟岛中，几个人柱力也在不断的沟通着体内的尾兽。
在宇智波的恐怖威胁下，所有的尾兽都和人柱力达成了共识，他们不想就这么被抓回去重新组合成十尾。他们很高兴能有现在的生活。
此时抓捕了三尾的宇智波斑在忍界疯狂的搜索着尾兽的位置，为此他甚至覆灭了云隐村，如果不是云隐早在宇智波斑袭击忍者联军总部后，就立刻遣散了所有普通人的话它或许和岩隐一样彻底消失在了忍界的历史上。
此时的龟岛不断的朝着远离忍界大陆的方向漂流。宇智波斑已也覆灭了雾隐。他在整个忍界寻找着人柱力，每一天都可以听到宇智波斑袭击破坏村落的消息。
...
一年后，掌握了龙地洞仙人模式的佐助杀死了大蛇丸。在当初兄长死亡时，佐助就在情绪的刺激下开起了三勾玉写轮眼。杀死了大蛇丸，佐助对内心没有任何的情感爆发。他并没有因为弑师而刺激情绪觉醒万花筒写轮眼。
漫步离开了大蛇丸的**，佐助他也在全忍界寻找着宇智波斑。为了给哥哥报仇佐助愿意付出任何的代价。
木叶水门收到了一个坏消息。龟岛遇到了入侵，人柱力藏于龟岛的情报被泄露了出去。
"集合所有人立刻前往龟岛，忍界的命运就在这一场战斗中决定了。"
无奈的叹息，水门无奈的下达了准备决战的命令。千川火羽还没有回来，此时忍者联军里，连和能够和宇智波斑战斗的人都没有。
但是即使是如此也必须要战斗。立刻集合了所有的忍者，忍界的强者们聚集在龟岛，等待着宇智波斑的来袭。
木叶，宇智波宅邸。随着有的死去，止水和带土被宇智波斑重伤，此时的宇智波一族也已经败落。富岳虽然重新凝聚了家族，但是依旧没能挽回颓势。